AEPA está dotada de una Asamblea General, órgano soberano de la asociación; sus miembros forman parte por derecho propio e irrenunciable de la misma.

Los miembros de la asociación, reunidos en Asamblea General legalmente constituida, deciden por mayoría los asuntos que son competencia de la Asamblea.

Todos los miembros quedan sujetos a los acuerdos de la Asamblea General, incluyendo a los ausentes, a los que discrepen y a los presentes que se han abstenido de votar.

AEPA, cuenta igualmente con una Junta Directiva, compuesta por el presidente, el vicepresidente, el secretario, el tesorero y los vocales, siendo sus facultades las de representar, dirigir y administrar la asociación de la manera más amplia que reconozca la Ley; así mismo, las de cumplir las decisiones tomadas por la Asamblea General, de acuerdo con las normas, instrucciones y directrices que esta Asamblea establezca.

Comisiones o grupos de trabajo

Para la mejor ejecución y desarrollo de los fines asociativos AEPA se dota de comisiones o grupos de trabajos, tales como Seguridad, Recursos Humanos.